Как убрать дубликаты родительских пунктов в боковом меню Есть решение

Дубликаты будут убраны, если вы переключите боковое меню в режим выпадения в сторону, а не вниз как у вас сейчас.

Это сделано потому, что категория при выпадении вниз открывается по клику (и у юзера не возможности открыть её - он может открыть только её дочерние категории), а при боковом выпадении меню открывается по наведению на категорию.

У клика есть только одно событие: либо переход по ссылке, либо раскрытие подпунктов меню.
Если сделать раскрытие меню вниз при наведении, то там начнётся жуткий треш, когда пользователь начнёт водить мышкой по меню. Всё будет прыгать и раздражать.

Поэтому первая ссылка раскрывает подменю, а вторая ведёт в категорию.

От дубликатов (ссылок в родительскую категорию) целесообразно избавляться в том случае, если у вас в родительской категории не будет ни одного товара.

Но есть один недостаток – это хлебные крошки.
В хлебных крошках будет отображаться эта родительская категория и если пользователь туда перейдёт, то он увидит пустую категорию без товаров.

Если это неприемлемо, то можно в главные категории добавить изображения подкатегорий при помощи плагина картинки для категорий.
(Эти же картинки будут тогда ещё отображаться в меню, только нужно включить опцию в настройках темы.)

В теме есть специальный дополнительный параметр, который (если его добавить) будет выводить картинки категорий точно таким же образом как и товары.
В настройках темы есть шпаргалка по всем доп. параметрам, используемым в теме.

Теперь вы знаете всё почему и чем грозит.
И если вам всё таки необходимо убрать дубликаты, то следуйте этой инструкции:

• Откройте приложение сайт - дизайн - ФУ - шаблоны - файл options.site.script.html
• В нём найдите строку:

      }
  {/if}
  {* / Убирать дубликаты родительских пунктов в горизонтально ориентированых меню, 
  	на устройствах без touch *} 

• И перед первой фигурной скобкой вставьте следующий код:

  $('.dropdown-down-onclick:not(.dropdown-plugins) > a.dropdown-toggle').each(function() {
  	var ddMenu = $(this).siblings('.dropdown-menu');
  	ddMenu.find('.dropdown-header, .divider').hide();
  });