Как скрывать артикулы, которых нет в наличии

В цикле перед выводом списка артикулов добавить проверку если артикул имеет статус available 0 то не выводить.

{if $sku.available==1}

Константин, спасибо за подсказку!
Только проверку нужно выполнять после строки:

{$sku_available =  $product.status && $sku.available && ($wa->shop->settings('ignore_stock_count') || $sku.count === null || $sku.count > 0)}

А не до неё, как указано у вас.

Опцию в тему добавил, но с оговорками:

• Только для артикулов из "вариантов покупки" (радио-кнопки, как на скрине выше).
  Для артикулов, генерируемых их "Выбора характеристик" опция не будет распространятся, т.к. нет возможности выполнить данную проверку.
• Опция именно в настройках темы будет доступна только после сброса настроек обновлённой версии темы, чтобы включить опцию в обход настроек, нужно будет "включить" вручную в начале файла product.cart.html